Magneettisten virtausmittareiden mittaus perustuu sähkömagneettiseen induktioon. Magneettisessa virtausmittarissa mittarin ylä- ja alapuolelle asetetut sähkömagneetit luovat väliinsä magneettikentän. Sähköäjohtavan aineen virratessa magneettikentän läpi putken molemmille puolille asetettujen elektrodien väliin syntyy jännite. Syntynyt jännite on suoraan verrannollinen aineen keskimääräiseen virtausnopeuteen. Magneettisen virtausmittarin elektroniikka muuntaa jännitteen ulostuloviestiksi. Toimintaperiaatteestaan johtuen magneettinen virtausmittari soveltuu ainostaan sähköä johtaville virtausaineille, kuten vedelle ja erilaisille kemikaaleille.